از آنجایی که بسیاری از این طلاب از خانواده‌ها‌ی طبقه‌‌ی پایین و متوسط و دارای زن و فرزند بودند، رفتن به خدمت سربازی مشکلات زیادی را برای آنها به وجود می‌آورد.

از اقدامات رژیم پهلوی برای تضعیف نهاد روحانیت، فرستادن طلاب به خدمت نظام وظیفه بوده است. یکی از هدف‌های رژیم از این اقدام جدا کردن طلاب از فضای حوزوی و متأثر کردن آنها از طریق آموزش‌های جدید بوده است. از آنجایی که بسیاری از این طلاب از خانواده‌ها‌ی طبقه‌‌ی پایین و متوسط و دارای زن و فرزند بودند، رفتن به خدمت سربازی مشکلات زیادی را برای آنها به وجود می‌آورد. دو سند زیر به اقدامات امام خمینی (ره) در این مورد در سال 1342 اشاره دارد. در سند اول می‌بینم که حضرت امام «مخارج یومیه‌ی آنها را تا خاتمه سربازی» تقبل کرده و در سند دوم از آنها می‌خواهد که «در سربازخانه به جای خدمت به تبلیغات دینی خود ادامه دهند.»